地区约三千名。官费生都进入较严谨的学校就读，问题出在自费生。他们多半是富家子弟，家中寄来的生活费甚至多到根本不符合留学生的身份。在鲁迅随笔中，曾写到有些留学生聚集的建筑物甚至因学跳舞而烟尘密布。
为了淘汰这些连间像样的教室也没有的“学店”，文部省当然会出手整顿。然而，此一“取缔规则”是在中国同盟会成立不久后公布，难免令留学生产生深切的怀疑。
于是留学生掀起罢课、全体退学、全体归国的声浪。
十一月二日的“官报”大概没有任何留学生会注意到。但到了十一月二十六日，各学校贴出公告，限定大清国留学生在二十九日之前提出原籍、现在住所、年龄、学籍、经历等数据。
众留学生至此方知“取缔规则”一事，也同时掀起骚动。实际上，虽有部分学生进行罢课，但就读军校者并未同步配合。
十二月七日的《朝日新闻》记载，关于大清国人联合罢课一事，因系出于大清国人特有的“放纵卑劣”行为，故其团结力亦薄弱，云云。
在该报刊出此一报道的翌日，十二月八日，一名中国人在大森的海边投海自尽。后来才由死者的“绝命书”中得知，死者是对报道中的“放纵卑劣”一词感到激愤而自尽。
自杀的中国人是在去年十月长沙起义时加入华兴会，并随同黄兴、宋教仁亡命日本的陈天华。
陈天华在留学生当中是个文笔出类拔萃者，将在富士见楼孙文欢迎会的孙文的演讲写成摘要的也是他，同时他还是同盟会章程的起草人之一。当时留学生最爱读的文章首推邹容的《革命军》，其次是陈天华的《警世钟》、《猛回头》。留学生中无人不知陈天华之名。
《二十世纪之###》改名为《民报》而成为同盟会的机关报一事早经决定，陈天华亦被选定为选稿人之一。他的“绝命书”一开头便写道：
呜呼，我同胞其亦知今日之中国乎？今日之中国，主权失矣，利权去矣，无在而不是悲观，未见有乐观者存。其有一线之希望者，则在于近来留学生日多，风气渐开也。使由是而日进不已，人皆以爱国为念，刻苦向学，以救祖国，即十年二十年之后，未始不可转危为安……
文章系长篇大论，可知他的自杀应非一时冲动之举。
被日本的报纸形容为“放纵卑劣”，陈天华愤怒难平，欲促同胞奋起。他的“绝命书”另载：
……鄙人心痛此言，欲我同胞时时勿忘此语，力除此四字，而做此四字之反面，坚忍奉公、力学爱国。恐同胞之不见听，而或忘之，故以身投东海，为诸君之纪念，诸君而念及鄙人也，则毋忘鄙人今日所言。
另外他还说，自己所能做的只有两件事，一是写《警世钟》、《猛回头》之类的书，一是死得其时，现得后者之良机，故当一死。
立场强硬的全体归国派与续留派各自分裂成“联合会”与“维持会”相争。同盟会当中亦有不同意见。例如同盟会的宋教仁、胡瑛、孙武等人主张全体归国，而胡汉民、汪兆铭、朱执信等人则主张续留。
起初归国派占优势，但因即将毕业的学生、军事相关院校的学生强硬地主张续留而形势逆转。
日本方面，十二月十九日，于帝国议会中在野的进步党要求取消“取缔规则”，执政党则以延期施行规则的方式做出让步，事实上也就是取消。
时日本也有加州的日裔移民抗议美国当局实行不法的差别待遇。倘若留学生的问题闹大后，恐会招来“日本岂非也对外籍学生给予不法的差别待遇”之反弹。
在此时，原已归国的约两千名学生又陆续复学返回日本。“取缔规则”的不施行是一种胜利，他们在申请复学时大摇大摆地穿过校门。
孙文在西贡闻知东京的学校骚动及陈天华自杀的消息。
“何苦学楚国前贤？此人死得遗憾！”
孙文喃喃自语。
楚国先贤是指屈原，乃两千三百年前的楚国大臣，为反秦派，在抗争中投身汨罗江殉国。
陈天华出身地湖南新化在古时属楚国，系知名水乡，有汨罗江流经。
“日本撤回取缔规则是受制于国际舆论的压力，非因天华投海自杀所致。真希望他还活着写出更多激励人心的文章。”
孙文不禁吟唱起陈天华的《警世钟》里的开头诗句：
长梦千年何日醒，
睡乡谁遣警钟鸣？
腥风血雨难为我，
好个江山忍送人！
万丈风潮大逼人，
腥膻满地血如糜；
一腔无限同舟痛，
献与同胞侧耳听。
在孙文出发去越南的前一天（一九○五年十月六日），由保皇会主办，在东京举行了一场追悼戊戌（变法）遭处死者及庚子（义和团事件）牺牲者的纪念会。保皇会与革命派一向水火不容，但同盟会还是派了胡汉民代表参加这场追悼纪念会。
在赴越南时，船刚过吴淞口之际，驻天津的法军参谋长布加卑（PaulBoucabeille）乘坐汽艇登船来，说是奉本国政府陆军大臣之命前来和孙文晤谈。
既见过俄国革命党员，又见了法国参谋长，孙文此行可说幸运之旅。
在西贡他又受到盛大欢迎，旅行成果之丰硕超乎原先的想象。革命经费顺利募得，还在河内及海防以兴学社之名设立了同盟会支会。
在新加坡也设立了同盟会支会，接着又巡回各地，直至翌年四月方从香港返回日本。
唯有失去陈天华一事让他感到痛心不已。