简单的大肠杆菌病毒的繁殖速度相比,大肠杆菌能在不到三十分钟的时间内复制出整个超过四百万对碱基的基因组。
布尔加特戴上了一双一次性的医用手套,从冰箱机架上取下一盒一英寸长密封的塑料试管。他选了一小瓶给艾琳看上面详细的标签,字非常小,写着治愈结构——最终版,还有日期。汉森也看了标签,他决定从始至终只做一个安静的观察者。
布尔加特用微量吸管从小瓶子里吸了一微升,无菌的塑料吸管顶端出现了一点点液体。10分钟,几次操作以后,超级序列魔力正在以超人类的速度进行结构排序,A、G、C和T的基因串列在屏幕上滚动,人眼根本没办法跟上,每个字母的颜色都不一样。
不到三十分钟,序列就完成了,六万对碱基对,检查了两次精确度。
“我可以直接把序列上传到在线网站吗?”艾琳说道。
“当然可以,”布尔加特回答道,“这台机器跟因特网无线连接。”他加了一句,汉森觉得根本没必要加这一句。现在还有什么设备是没有和因特网无线连接的吗?
“好的,”艾琳说道,“请打开GeneRepository.com,”她发出指令。
“从来没听说过。”布尔加特说道。
艾琳耸耸肩,“那又怎么样?”
“那么,没有一个数据库是包含所有基因序列的,CodeMaestro是最全的。”
“GeneRepository有更多的病原体的完整序列,”艾琳说道,“而且软件更好。”
布尔加特轻蔑地盯着艾琳,“你怎么会知道数据库的事儿?”他说道,“你什么时候干过分子生物学的事儿?”
“没有你那么经常,”艾琳愤愤地说,很明显地被这位矮个子遗传生物学家惹恼了。“但是我的研究领域也会使用这些工具。看上去我了解你的领域比你了解我的多。”
汉森觉得是时候介入一下了,“这太荒谬了,”他说道,“管他呢?两个网站都有鼻病毒序列,对吧?所以让艾琳用她喜欢用的那个好了。这是她提出的要求。”
布尔加特点点头,“你是对的,”但是忍不住转向艾琳又加了一句,“你还是不对。要是我都没听说过的序列数据库,肯定不是什么好数据库。”
两分钟之内,他们就登上了艾琳想进入的那个网站。网页非常简洁,没有任何花哨的内容,很容易使用——就像是谷歌的搜索栏。汉森想可能就是因为如此,她才喜欢吧。
超级序列魔力上传了序列。DNA片段的长度非常长,必须检查开始点和结束点,以及不同的排列组合,就是核对鼻病毒数据库都花了好几分钟。最后网站显示序列跟传统的鼻病毒有84%的相似。
布尔加特喜形于色,“满意了吧?”
艾琳点点头。“基本满意,”她说道,然后又指挥软件检查所有已知病原体,寻找有50%或以上的相似度。这可就是更大更复杂的工作,至少要花上一个小时才能完成。